Le 28 juillet 1865, un groupe de 150 immigrés gallois quitta le voilier « Mimosa » sur les rives de l’actuel Puerto Madryn. C’est la date qui est à présent comprise comme étant la fondation de la ville et son nom, en hommage à Loves Jones Parry, le baron de Madryn à l’époque, à Whales. Les eaux calmes et protégées du Golfo Nuevo ont été l’invitation à la désignation de cette ville portuaire. En tant que principal port de commerce de la région, Puerto Madryn a abrité la gare centrale de Chubut de 1890 à 1961, transformant cette petite ville portuaire en une ville cosmopolite avec des plans inévitables de croissance future. La ville s’est développée principalement autour des activités du port et de la gare, ainsi que du commerce et des services.
Les politiques nationales et internationales ont compliqué la croissance systématique de la région. Certains aspects ont favorisé la création d’usines, d’autres ont mis fin aux transports et aux communications régionaux, comme c’est le cas du service ferroviaire. Aujourd’hui transformée en musée historique, la gare montre un échantillon d’un passé pas si lointain.
Dans les années 60, plusieurs industries textiles se sont installées à Puerto Madryn en raison de certaines exonérations fiscales, mais plusieurs années plus tard, elles ont toutes été fermées, ce qui a entraîné une diminution de la population locale, nombre d’entre elles s’étant éloignées faute de travail.
Avec l’arrivée d’Aluar et de son usine de production d’aluminium, ainsi que son nouveau port et son port industriel dans les années 70, la population a explosé. En moins de 10 ans, la population de Puerto Madryn avait triplé. D’autres industries ont rejoint l’expansion, créant encore plus de croissance avec des familles venant de tous les coins du pays.
D’autre part, une nouvelle tendance se dessinait dans la province de Chubut en ce qui concerne la protection de l’environnement et les débuts d’une nouvelle main-d’œuvre dans le domaine de l’éco-tourisme. Grâce à un groupe de personnes qui considéraient la nature unique de la région comme une ressource digne d’être protégée, Chubut est devenue une province pionnière dans le domaine des réserves naturelles. En quelques années, plusieurs régions clés ont reçu le statut de zones protégées ou immatérielles.
Le 29 septembre 1967, la réserve naturelle de Punta Loma a été créée. C’était la première réserve naturelle établie à Chubut, à seulement 17 km de Puerto Madryn. Ses deux plates-formes d’observation permettent d’observer discrètement les otaries.